Posted by Chem Blog on Minggu, 25 Desember 2011
1.Buatlah Gambar Fenol dengan Hyperchem lalu simpan
Sifat-sifat
Atom
Saat
anda memilih suatu atom, misalnya atom O pada gambar yang anda buat di Latihan
2, pada status line akan tertera nomor
atom, jenis atom, serta muatan untuk medan gaya mekanika molekuler saat itu.
Koordinat x, y, dan z dari atom itu juga ditampilkan. Bersamaan dengan itu,
pada menu Build, item set atom Type,
Set Charge, dan Constrain Geometry menjadi aktif, sehingga anda dapat
menetapkan sifat-sifat atomik non-default
Mengukur
Panjang Ikatan
Saat
anda memilih suatu ikatan, misalnya ikatan C-O pada gambar yang anda buat di
Latihan 2, panjang ikatan tersebut akan tertera pada status line. Nilai yang ditampilkan ialah panjang ikatan default antar atom dengan jenis dan
hibridisasi tertentu, yang tersedia pada perpustakaan Hyperchem. Jika panjang
ikatan default tidak tersedia,
Hyperchem menggunakan rerata jejari kovalen kedua atom yang berikatan. Anda
juga dapat menetapkan panjang ikatan non-default
dengan memanfaatkan item Constrain Bond Length pada menu Build, yang menjadi
aktif saat ikatan dipilih
Mengukur
Sudut Ikatan
Untuk
mengukur sudut ikatan, misalnya < (C-O-H) pada gambar yang anda buat
dilatihan 2, deret kiri menghubungkan kedua atom ujungnya, yaitu dari atom H
atau sebaliknya, lalu lepaskan mouse. Sudut itu akan diberi highlight dan nilai
default-nya, yaitu yang ditetapkan berdasarkan hibridisasi: tetrahedral (109o),
trigonal (120o),atau linear (180o), akan tertera dalam
status line. Anda dapat memasukkan sudut ikatan non-default menggunakan item
Constrain Bond Angle pada menu Build, yang menjadi aktif saat anda memulai
pengukuran sudut ikatan
Mengukur
Sudut Torsi
Sudut
torsi (empat atom) A-B-C-D ialah sudut antara A dan D saat diamati sepanjang
ikatan B-C (seperti saat anda membuat proyeksi Newman). Untuk mengukurnya,
misalnya torsi C-C-N-H pada gambar yang anda buat di Latihan 2, seret kiri
menghubungkan kedua atom ujungnya, yaitu dari atom C cincin ke atom H, lalu lepaskan mouse. Torsi itu akan diberi highlight dan status line menunjukan nilai -60o (gauche). Dengan
memanfaatkan item Constrain Bond Torsion pada menu Build yang menjadi aktif
saat dimulainya pengukuran sudut torsi, anda dapat menetapkan sudut torsi
ikatan non-default
Mengukur
Jarak Antar Atom Yang Tidak Berikatan
Pastikan
item Multiple Selections pada menu
Select terpilih, lalu klik kiri dua atom
mana saja yang tidak berikatan. Jarak di antara mereka tertera pada status line.
Ikatan
Hidrogen
Untuk
menampilkan ikatan hidrogen antara atom N dari gugus amino dan atom H dari
gugus hidroksil pada gambar yang anda buat di Latihan 2, aturlah agar ikatan
O-H-N mendekati linear. Kemudian klik kiri Display-Show Hydrogen Bonds,
dilanjutkan dengan klik kiri Display-Recompute H Bonds. Hyperchem menampilkan
ikatan hidrogen sebagai garis putus-putus